Bir bakterinin metobolizması canlandırıldı

Stanford Üniversitesi bilim insanları ilk kez bilgisayarda tüm bir organizmanın simülasyonunu gerçekleştirdi. Bir bakterinin metobolizması canlandırıldı.

Araştırmacılar bu amaçta Mycoplasma genitalium bakterisiyle ilgili dokuz yüzü aşkın bilimsel çalışma inceledikten sonra, hücrede deneysel olarak kanıtlanan 1900 süreci saptadı. Her biri bir yazılım modülünü çalıştıran 28 algoritmayla, bir Mycoplasma genitalium bakterisine ait 525 geninin işlevi bir simülasyonda canlandırıldı. 28 modül, simülasyonun her adımında birbiriyle iletişime giriyor ve bu bakterinin gerçek davranışlarına çok benzer bir bütün oluşturuyor. E.coli gibi organizmaların da bilgisayar modelleri üretilebilecek. Mycoplasma genitalium, en küçük genoma sahip olması nedeniyle simülasyon için çok uygun. İnsanın genital sisteminde ve solunum yollarında yaşayan bakteri bazı iltihaplanmalarda rol oynuyor. Araştırmacılar, organizmaların simülasyonları sayesinde gelecekte, canlı deney hayvanlar üzerinde çalışmadan değişimleri canlandırabilmeyi umuyor. Bilgisayar modelleri uzun vadede özellikle de metabolizma hastalıklarının simülasyonları ve tedavileri için kullanılacak. Simülasyon için işlenen veri miktarı büyük. Daha gelişkin organizmaların karmaşıklığı bu yüzden halihazırdaki olanakları aşıyor. E.coli bile 4.288 geniyle Mycoplasma genitalium’dan çok daha karmaşık yapılı. Özellikle de süreçlerin karşılıklı etkileşimleri araştırmacılar için sorun yaratıyor. CUMHURİYET BİLİM TEKNOLOJİ EKİ

---