Bilim adamları ilk kez organizmanın bilgisayar modelini yaptı

Amerikalı bilim adamları, yaşam döngüsünün incelenmesine olarak tanımak için ilk kez bir organizmanın bilgisayar modelini yaptı.

Amerikalı bilim adamları, yaşam döngüsünün  incelenmesine olarak tanımak için ilk kez bir organizmanın bilgisayar modelini  yaptı. "Cell" dergisinde yayımlanan araştırmada, Stanford Üniversitesi  Biyoteknik Bölümü'nden Doç. Dr. Markus Covert başkanlığındaki bilim adamları,  başka organizmalara bağımlı olmadan yaşayan dünyanın en küçük bakterisi  Mikoplazma genitalyum'un DNA'sının ve bakterinin tek bir hücresindeki  bileşenlerin simülasyonunu yaptı.

Araştırmacılar, bakterinin yaşam döngüsünde yer alan her bir moleküler  etkileşim için 900'den fazla bilimsel çalışmayı inceledi. Hücrenin geniş kapsamlı bilgisayar modeli, hem hücrelerin işlevlerinin  anlaşılmasına yardımcı olacak hem de hastalıkların teşhis ve tedavisine önemli  katkıda bulunacak. Doç. Dr. Covert, kanser, Alzheimer gibi hastalıkların tek bir genle  ilgili olmadığını, yüz binlerce genin birbiriyle etkileşim halinde olmasının  karmaşık bir sonucu olarak tanımlanmaları gerektiğini belirtti. Covert, bilgisayar modelinin genler arasındaki etkileşimin anlaşılmasına  yardımcı olacağına işaret etti. İnsanların idrar yolları ve cinsel organlarının yanı sıra solunum  sisteminde görülen Mikoplazma genitalyum, organizmalar arasında en küçük genoma  sahip. Mikoplazma genitalyum, 4288 gene sahip E. coli bakterisinin tersine sadece  525 gen taşıyor. Bilim adamları, cinsel yollarla bulaşan bakteriyi küçük genomu için  tercih etti. Bakterinin bilgisayar modelini yapmak için 1900'den fazla parametreden  yararlanan araştırmacılar, biyolojik süreçleri her biri kendi algoritması  tarafından yönetilen 28 farklı modül olarak tasarladı. Daha sonra bu modüller,  birbirleriyle etkileşime geçirilerek bir bütün olarak çalışmaları sağlandı. Araştırmada DNA'ları birleştiren protein dinamikleri ve yeni gen  işlevleri de ayrıntılı olarak tanımlandı. Simulasyon, araştırmacılara çok sayıda etkileşim faktöründen kaynaklanan  hücre davranışını gözlemleme fırsatı da tanıdı. Araştırmacılar, model sayesinde hücre döngüsündeki her bir evrenin  hücreden hücreye farklılık gösterdiğini ortaya çıkardı. AFP